El sistema de salud comprende los sectores público y privado, El sector público incluye el Ministerio de Salud y el Instituto Salvadoreño del Seguro Social, que en conjunto cubren a la mayor parte de la población salvadoreña. La cobertura nacional de servicios esenciales para 2019 se estimó en 76%.
El gasto público en salud representó el 4,7% del PIB, por debajo del 6% que recomienda la Organización Panamericana de la Salud (OPS), y el 17,4% del gasto público total para 2019. El gasto de bolsillo en salud igualó el 33% del gasto total en salud en 2020, que es relativamente alto y supera el punto de referencia de la OPS del 20%. El gasto catastrófico para 2018 se estimó en el 1,7%.
