Система здравоохранения включает в себя государственный и частный секторы. Государственный сектор включает в себя Министерство здравоохранения и Институт социального обеспечения Сальвадора, которые вместе охватывают большую часть населения страны. Национальный охват основными услугами на 2019 год оценивается в 76%.
Государственные расходы на здравоохранение составили 4,7% ВВП, что ниже 6%, рекомендуемых Панамериканской организацией здравоохранения (ПАОЗ), и 17,4% всех государственных расходов в 2019 году. Расходы на здравоохранение за счет собственных средств составят 33% от общих расходов на здравоохранение в 2020 году, что является достаточно высоким показателем и превышает рекомендованный ПАОЗ уровень в 20%. Катастрофические расходы в 2018 году оценивались в 1,7%.
