El coste total del PNDS para el periodo 2022-2026 se ha estimado en Mil Seiscientos Treinta y Cuatro Millones Seiscientos Setenta y Siete Millones Cuatrocientos Noventa y Un Mil Ciento Setenta y Siete Francos CFA (1.634.677.491.167 FCFA ) o aproximadamente 2.972.140.893 USD . Este coste incluye todas las necesidades de financiación que deben cubrirse para llevar a cabo las intervenciones prioritarias con el fin de alcanzar los objetivos fijados, y representa el coste total del gasto sanitario en que deben incurrir los servicios de salud públicos y privados para garantizar la prestación de una atención de calidad a la mayoría de la población.
Los mecanismos de financiación del PNDS III se basarán esencialmente en : (i) el presupuesto público (Estado y socios) ; (ii) recuperación de costes con participación de los hogares; (iii) la BPF, que cubre el equivalente al 40% de la población centroafricana de las regiones; (iv) donaciones.